Onderzoekers onderzochten of pairwise (tweerichtings)interacties voldoende zijn om samenlevingen van microben te voorspellen, een vraag waar sommige ecologen aan twijfelen omdat eerdere studies vaak kunstmatige combinaties gebruikten. Het Tufts-team nam een andere aanpak: ze isoleerden microben uit echte zuurdesemstarters, maten de groei van elke soort in monocultuur en in paren, en parametriseerden daarmee een voorspellend model. Ze valideerden de voorspellingen met gemeenschappen van meerdere soorten die samen in petrischalen werden gekweekt, tot negen soorten.
Het model bleek betrouwbare voorspellingen te geven over welke microben samenleven en over hun relatieve abundantie. Alleen twee van de negen soorten gedroegen zich significant anders dan verwacht. De onderzoekers verbeterden de voorspellende kracht door in het model de levenscyclus van een zuurdesemstarter op te nemen: dagelijks voeren, een deel gebruiken en de rest aanvullen, wat zorgt voor herhaalde periodes van afname en herstel van populaties.
Door die herhaalde reducties te modelleren werd duidelijk waarom sommige langzaam groeiende soorten anderen niet volledig verdringen: zij planten zich niet snel genoeg voort tussen de verdunningen door om volledig te domineren. De auteurs noemen toepassingen voor bakkerijprocessen, voedselveiligheid en menselijke gezondheid, en werken verder aan modellen die microbiele evolutie volgen, omdat evolutie eigenschappen van een starter of iemands darmmicrobiota in de tijd kan verschuiven. Bron: Tufts University.
- Voorbeelden: antibioticabehandelingen van de darm
- sanering van voedselverwerkingsapparatuur
- verstoringen van bodemmicroben door pesticiden
Moeilijke woorden
- interactie — wederzijdse invloed tussen twee soorteninteracties
- monocultuur — kweek van één soort alleen
- parametriseren — waarden voor een model vastleggenparametriseerden
- abundantie — hoeveelheid van een soort ten opzichte van anderenrelatieve abundantie
- levenscyclus — afwisseling van groei en verval in tijd
- verdunning — vermindering van concentratie door toevoegenverdunningen
- domineren — overheersen waardoor andere soorten minder worden
- evolutie — langzame verandering van eigenschappen door tijd
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Welke gevolgen kan het gebruik van zo'n voorspellend model hebben voor bakkerijprocessen of voedselveiligheid? Geef twee mogelijke voorbeelden.
- Waarom is het belangrijk om microben uit echte starters te gebruiken in plaats van kunstmatige combinaties?
- Hoe kan evolutie het gedrag van een starter of de darmmicrobiota in de tijd veranderen volgens de tekst? Noem mogelijke effecten.
Gerelateerde artikelen
UNESCO-rapport: tekort aan gegevens en risico's voor meisjes
Een UNESCO-rapport (gepubliceerd op 27 april) toont grote gaten in onderwijsgegevens uit armere landen en waarschuwt dat meisjes in sommige regio's nog steeds weinig toegang tot onderwijs hebben. Het pleit voor betere monitoring en meer rolmodellen.
Rapport: Oeganda moet wetenschap en innovatie hervormen
Een rapport gepresenteerd op 21 juni zegt dat Oeganda zijn systemen voor wetenschap, technologie en innovatie moet verbeteren. Het rapport noemt een genderkloof, zwakke STI-financiering en pleit voor meer samenwerking met het bedrijfsleven.