Новые микробы в кишечнике африканских популяций ^{CEFR B2}

Команда под руководством Sydney Brenner Institute for Molecular Bioscience (SBIMB) при Университете Витватерсранда опубликовала в Nature исследование кишечного микробиома примерно у 1 800 женщин из Кении, Ганы, Буркина‑Фасо и Южной Африки. Участницы предоставляли образцы фекалий, которые прошли генетическое секвенирование для точной идентификации микроорганизмов.

Учёные обнаружили более 1 000 новых видов бактерий и свыше 40 000 новых вирусов; в сумме они отмечают более 40 000 ранее неизвестных кишечных микробов в африканских популяциях. Одной из важных находок стал уникальный микробный «отпечаток», связанный с ВИЧ. Это крупнейшее на сегодня исследование микробиомов женщин с ВИЧ, и авторы отмечают, что бактериальные паттерны у таких людей в Африке существенно отличаются от наблюдаемых в более богатых странах, что может повлиять на разработку диагностических и лечебных подходов.

Учёные сравнили сельских и городских участниц и выяснили, что у жителей сельской местности микробиом богаче и разнообразнее. В городах часто отсутствовала бактерия Treponema, что исследователи связывают с меньшим потреблением клетчатки и более частым применением антибиотиков. Шарисса Наиду, содиректор African Microbiome Institute, предупредила о постепенном исчезновении полезных кишечных бактерий в условиях урбанизации и призвала к срочным нутриционным мерам. Исследование также подчёркивает различия между городами и регионами под влиянием местных диет, окружающей среды и культурных практик и заполняет пробелы, оставшиеся после Human Microbiome Project 2007 года. В дальнейшем команда планирует изучать связи микробиома с нарушениями сна, менопаузой, заболеваниями мозга и туберкулёзом. Материал подготовлен англоязычным отделом SciDev.Net по странам Субсахарской Африки.