Новое исследование команды Габриэля D. Викторы подробно проследило тысячи B‑клеток в 119 герминативных центрах у генетически модифицированных мышей. Учёные настроили модель так, что все конкурирующие B‑клетки начинали с одной и той же немутировавшей последовательности антител; затем прививкой вызвали образование герминативных центров и наблюдали динамику конкуренции и отбора.
Для анализа использовали мультифотонную микроскопию, лазерную фотоактивацию и секвенировали тысячи отдельных B‑клеток. Параллельно был составлен «словарь» мутаций с помощью глубинного сканирования мутаций (Deep Mutational Scanning, DMS), которое связывает почти каждую возможную замену аминокислоты с параметрами антител, такими как аффинность и структурная стабильность. Первый автор Ашни Вора отмечает, что DMS стал «главным техническим прорывом».
На уровне отдельного герминативного центра эволюция часто выглядит почти случайной: одни линии клонально вспыхивают и захватывают центр, другие исчезают, а многообещающие мутации иногда проваливаются. В то же время процесс смещён в сторону полезных мутаций: повторение множества шумных раундов отбора в большом числе центров последовательно даёт более сильные антитела. Авторы также обнаружили склонность системы отдавать предпочтение мутациям, которые её машинерия легче реализует, а не всегда тем, что давали бы наибольшую аффинность.
Выводы опровергают некоторые прежние представления о работе герминативных центров и имеют практическое значение для разработки вакцин против быстро мутирующих патогенов, таких как грипп и ВИЧ. Кроме того, иммунная система может служить полезной моделью для изучения процессов эволюции. Источник исследования: Rockefeller University.
Сложные слова
- герминативный центр — место в лимфоидной ткани для созревания клеток иммунной системыгерминативных центрах, герминативного центра
- аффинность — сила связывания антитела с антигеном
- отбор — выбор лучших вариантов в системеотбора
- мутация — изменение последовательности ДНК или белкамутаций, мутации
- секвенировать — читать или определять порядок нуклеотидовсеквенировали
- глубинное сканирование мутаций — метод проверки многих вариантов мутаций одновременноглубинного сканирования мутаций
Подсказка: наведите, сфокусируйтесь или нажмите на выделенные слова, чтобы увидеть краткие определения прямо во время чтения или прослушивания.
Вопросы для обсуждения
- Как вы думаете, почему полезные мутации иногда проваливаются в отдельных герминативных центрах, несмотря на их преимущество?
- Какие преимущества и ограничения даёт использование генетически модифицированных мышей для изучения эволюции антител и герминативных центров?
- Как данные глубокого сканирования мутаций (DMS) можно применить при разработке вакцин против быстро мутирующих вирусов?
Похожие статьи
Вспышка Эболы штамма Bundibugyo в ДРК и Уганде
В начале мая началась вспышка штамма Эболы Bundibugyo в восточных провинциях ДРК; она перешла в Уганду и вызывает опасения о распространении дальше. По состоянию на 25 июня в ДРК и Уганде зарегистрированы подтверждённые случаи и летальные исходы.