Une équipe de chercheurs a mis au point une technique pour synthétiser et éditer des génomes entiers de bactériophages, avec la possibilité d'ajouter ou de retirer des gènes individuels. Le travail répond au besoin d'alternatives alors que la résistance aux antibiotiques augmente.
Les chercheurs ont modélisé l'ADN synthétique à partir de deux phages naturels qui attaquent Mycobacterium, un groupe qui comprend les agents de la tuberculose et de la lèpre. Certains phages de Mycobacterium ont une forte teneur en bases G et C (environ 65%), ce qui complique la synthèse par les méthodes traditionnelles. Des génomes avec des proportions de bases plus équilibrées, comme ceux d'E. coli, sont plus faciles à éditer.
Pour surmonter ces obstacles, Graham Hatfull (Université de Pittsburgh) a collaboré avec Greg Lohman (New England Biolabs) et la société Ansa Biotech. Ching‑Chung Ko est le premier auteur de l'article publié dans les Proceedings of the National Academy of Sciences.
Les équipes ont synthétisé chimiquement l'ADN identique à deux phages naturels : BPs, un virus de 40,000 paires de bases utilisé cliniquement pour traiter une bactérie qui infecte souvent des personnes atteintes de fibrose kystique, et Bxb1, qui compte 50,000 paires de bases. Ils ont construit chaque génome en 12 sections puis inséré ces sections dans une cellule, qui a produit des phages.
Le laboratoire de Hatfull conserve 28,000 phages et une bibliothèque d'environ 5,500 génomes. Les génomes synthétiques pourraient accélérer la recherche d'un phage correspondant aux échantillons de patients et réduire le besoin de stocker de nombreux échantillons physiques. Créer des génomes à partir d'informations pourrait un jour remplacer la conservation de dizaines de milliers de phages sur glace.
Mots difficiles
- synthétiser — fabriquer une substance en laboratoiresynthétisé
- éditer — modifier le matériel génétique d'un organisme
- bactériophage — virus qui infecte les bactériesbactériophages
- résistance — capacité d'un microbe à survivre aux médicaments
- teneur — quantité d'un élément dans un mélange
- paire de bases — deux bases qui se lient dans l'ADNpaires de bases
- bibliothèque — collection organisée d'éléments scientifiques ou de données
Astuce : survolez, mettez le focus ou touchez les mots en surbrillance dans l’article pour voir des définitions rapides pendant que vous lisez ou écoutez.
Questions de discussion
- Quels avantages et quels risques voyez-vous à remplacer la conservation physique de phages par la création de génomes à partir d'informations ?
- Comment cette technique pourrait-elle aider les patients touchés par des bactéries résistantes aux antibiotiques ? Donnez des exemples simples.
- Pourquoi, selon le texte, un équilibre des bases facilite-t-il l'édition par rapport à une forte teneur en G et C ?
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