Een team van onderzoekers ontwikkelde een methode om volledige synthetische faaggenomen te bouwen en precies te bewerken. Het werk werd uitgevoerd in samenwerking tussen universitaire en commerciële groepen en staat in Proceedings of the National Academy of Sciences. De eerste auteur is een onderzoeksmedewerker uit het laboratorium van de hoofdonderzoeker.
De onderzoekers modelleerden synthetisch DNA naar twee natuurlijke fagen die Mycobacterium aanvallen, een groep waartoe ook de ziekteverwekkers van tuberculose en lepra behoren. Sommige faaggenomen bestaan voor ongeveer 65% uit G en C, en dat maakt synthese technisch lastig. Traditionele methoden werken beter voor genomen met meer evenwichtige baseverhoudingen.
Het team bouwde chemisch identieke DNA‑stukken van de fagen BPs en Bxb1 en voegde die in cellen in. De cellen volgden de instructies in het nieuwe genoom en produceerden fagen. Het laboratorium bewaart duizenden fagen en honderden genoomvermeldingen. Synthetische genomen kunnen het proces van het vinden van een passende faag voor patiëntmonsters versnellen en de noodzaak om veel fysieke monsters te bewaren verminderen.
Moeilijke woorden
- faaggenoom — het complete DNA van een bacteriofaagfaaggenomen
- synthetisch — gemaakt door mensen, niet door de natuursynthetische
- genoom — de volledige erfelijke informatie van een organisme
- bewerken — iets veranderen of aanpassen aan iets
- modelleren — een model maken op basis van iets andersmodelleerden
- baseverhouding — verhouding tussen verschillende basen in het DNAbaseverhoudingen
- versnellen — iets sneller laten gebeuren of maken
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Zou jij het goed vinden als ziekenhuizen synthetische fagen gebruiken voor patiëntmonsters? Waarom?
- Wat vind je van het idee dat laboratoria minder fysieke monsters bewaren? Geef één reden.
- Welke mogelijke voordelen of problemen zie je bij het bouwen van synthetische genomen?
Gerelateerde artikelen
Algen vangen microplastics in afvalwater
Onderzoekers van de University of Missouri gebruiken genetisch aangepaste algen die limoneen maken. De algen trekken waterafstotende microplastics aan, vormen klonten die zinken en kunnen zo water zuiveren en materialen voor bioplastic leveren.
Meer verborgen gewervelde soorten dan gedacht
Een studie vindt dat veel erkende gewervelde soorten verborgen, 'cryptische' soorten kunnen verbergen. DNA-onderzoek laat zien dat er mogelijk veel meer soorten bestaan, en veel van deze onopgemerkte soorten hebben geen wettelijke bescherming.
Tijd van behandeling beïnvloedt reactie van glioblastoom op chemotherapie
Nieuw onderzoek toont aan dat het tijdstip van behandeling kan veranderen hoe glioblastoom reageert op temozolomide. MGMT-activiteit en methylatie wisselen door de dag; onderzoekers stellen chronodiagnostiek en chronotherapie voor.
