Een team van onderzoekers ontwikkelde een methode om volledige synthetische faaggenomen te bouwen en precies te bewerken. Het werk werd uitgevoerd in samenwerking tussen universitaire en commerciële groepen en staat in Proceedings of the National Academy of Sciences. De eerste auteur is een onderzoeksmedewerker uit het laboratorium van de hoofdonderzoeker.
De onderzoekers modelleerden synthetisch DNA naar twee natuurlijke fagen die Mycobacterium aanvallen, een groep waartoe ook de ziekteverwekkers van tuberculose en lepra behoren. Sommige faaggenomen bestaan voor ongeveer 65% uit G en C, en dat maakt synthese technisch lastig. Traditionele methoden werken beter voor genomen met meer evenwichtige baseverhoudingen.
Het team bouwde chemisch identieke DNA‑stukken van de fagen BPs en Bxb1 en voegde die in cellen in. De cellen volgden de instructies in het nieuwe genoom en produceerden fagen. Het laboratorium bewaart duizenden fagen en honderden genoomvermeldingen. Synthetische genomen kunnen het proces van het vinden van een passende faag voor patiëntmonsters versnellen en de noodzaak om veel fysieke monsters te bewaren verminderen.
Moeilijke woorden
- faaggenoom — het complete DNA van een bacteriofaagfaaggenomen
- synthetisch — gemaakt door mensen, niet door de natuursynthetische
- genoom — de volledige erfelijke informatie van een organisme
- bewerken — iets veranderen of aanpassen aan iets
- modelleren — een model maken op basis van iets andersmodelleerden
- baseverhouding — verhouding tussen verschillende basen in het DNAbaseverhoudingen
- versnellen — iets sneller laten gebeuren of maken
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Zou jij het goed vinden als ziekenhuizen synthetische fagen gebruiken voor patiëntmonsters? Waarom?
- Wat vind je van het idee dat laboratoria minder fysieke monsters bewaren? Geef één reden.
- Welke mogelijke voordelen of problemen zie je bij het bouwen van synthetische genomen?
Gerelateerde artikelen
Genetisch onderzoek: veel zelfdodingen zonder depressie
Een studie van de University of Utah analyseerde genetische gegevens van meer dan 2,700 mensen die door zelfdoding overleden. Veel van deze slachtoffers hadden geen gedocumenteerde depressie of suïcidale voorgeschiedenis, wat screening bemoeilijkt.
Nieuw synthetisch gel ondersteunt borstkliercellen
Tijdens de pandemie maakten onderzoekers van UC Santa Barbara een op algen gebaseerd synthetisch gel om borstklier-epitheelcellen te bestuderen. Het materiaal ondersteunt normale weefselontwikkeling en kan worden aangepast om celgroei te sturen.