Onderzoekers rapporteerden een nieuwe aanpak om bacteriofaag‑genomen synthetisch te construeren en te bewerken. Graham Hatfull en collega’s werkten samen met andere wetenschappers en een bedrijf om processen te ontwikkelen die de technische hindernissen bij het maken van high‑GC‑DNA overwinnen. De bevindingen verschenen in Proceedings of the National Academy of Sciences.
De groep maakte chemisch identieke genomen van twee natuurlijke fagen die Mycobacterium aanvallen. Deze fagen hebben een hoge concentratie G‑ en C‑basen (ongeveer 65%), wat traditionele DNA‑synthese bemoeilijkt. De onderzoekers bouwden elk genoom in stukken en voegden die in een cel in; de cel las het genoom en produceerde functionele fagen. Een van de fagen, BPs, is een virus van 40,000 baseparen dat klinisch wordt gebruikt tegen een bacterie die vaak mensen met cystische fibrose infecteert; de andere, Bxb1, heeft 50,000 baseparen.
Het team merkt op dat er veel variatie is tussen fagen en dat de rol van veel genen nog onduidelijk is. Met nauwkeurige genoomwijzigingen kunnen onderzoekers specifieke genen verwijderen of veranderen en zo beter begrijpen hoe fagen werken. Het laboratorium van Hatfull bewaart 28,000 fagen en onderhoudt een bibliotheek van ongeveer 5,500 phagegenomen. Synthetische genomen zouden het zoeken naar passende fagen voor patiëntmonsters kunnen versnellen en mogelijk het bewaren van tienduizenden fagen op ijs vervangen.
Moeilijke woorden
- genoom — Alle genetische informatie van een organisme.genomen
- synthetisch — Gemaakt door mensen, niet natuurlijk ontstaan.
- overwinnen — een probleem of moeilijkheid succesvol oplossen
- bemoeilijken — iets moeilijker of ingewikkelder makenbemoeilijkt
- concentratie — hoeveelheid van een stof per volume of massa
- functioneel — die werkt zoals bedoeld of bruikbaar isfunctionele
- versnellen — iets sneller laten gebeuren of verlopen
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Welke voordelen en mogelijke risico's zie je bij het gebruik van synthetische fagen voor patiënten?
- Hoe kan een bibliotheek van duizenden phagegenomen het werk van onderzoekers en artsen veranderen?
- Denk je dat synthetische genomen het bewaren van tienduizenden fagen op ijs kunnen vervangen? Waarom wel of niet?
Gerelateerde artikelen
Celtransplantatie verbetert hart en bloedvaten na ruggenmergletsel
Onderzoekers plaatsten onvolledig gedifferentieerde zenuwcellen in een rattenmodel met ruggenmergletsel. De circulatie verbeterde: de bloeddruk in rust stabiliseerde en de gemiddelde hartslag daalde. Hormonale reacties bleven aanwezig, en toekomstig werk wil die reacties verminderen.
Genetische variant vergroot risico op hartfalen bij kinderen met myocarditis
Een studie vindt dat een genetische afwijking waarschijnlijk het risico verhoogt dat sommige kinderen met myocarditis hartfalen of gedilateerde cardiomyopathie krijgen. Onderzoekers pleiten voor meer genetische tests bij getroffene kinderen.
Kerala benoemt Bacillus subtilis tot staatsmicrobe
Kerala heeft Bacillus subtilis officieel aangewezen als staatsmicrobe om het gebruik van nuttige micro-organismen te promoten voor gezondheid, landbouw, milieu en klimaatresistentie. Een nieuw centrum wil toepassingen ontwikkelen en startups ondersteunen.
Virtueel dieet- en beweegprogramma helpt mensen met lymfoom tijdens chemotherapie
De LIFE-L-studie toont dat een online dieet- en beweegprogramma patiënten met lymfoom kan helpen de voorgeschreven chemotherapie te blijven volgen en tegelijkertijd klachten tijdens de behandeling vermindert.