Onderzoekers rapporteerden een nieuwe aanpak om bacteriofaag‑genomen synthetisch te construeren en te bewerken. Graham Hatfull en collega’s werkten samen met andere wetenschappers en een bedrijf om processen te ontwikkelen die de technische hindernissen bij het maken van high‑GC‑DNA overwinnen. De bevindingen verschenen in Proceedings of the National Academy of Sciences.
De groep maakte chemisch identieke genomen van twee natuurlijke fagen die Mycobacterium aanvallen. Deze fagen hebben een hoge concentratie G‑ en C‑basen (ongeveer 65%), wat traditionele DNA‑synthese bemoeilijkt. De onderzoekers bouwden elk genoom in stukken en voegden die in een cel in; de cel las het genoom en produceerde functionele fagen. Een van de fagen, BPs, is een virus van 40,000 baseparen dat klinisch wordt gebruikt tegen een bacterie die vaak mensen met cystische fibrose infecteert; de andere, Bxb1, heeft 50,000 baseparen.
Het team merkt op dat er veel variatie is tussen fagen en dat de rol van veel genen nog onduidelijk is. Met nauwkeurige genoomwijzigingen kunnen onderzoekers specifieke genen verwijderen of veranderen en zo beter begrijpen hoe fagen werken. Het laboratorium van Hatfull bewaart 28,000 fagen en onderhoudt een bibliotheek van ongeveer 5,500 phagegenomen. Synthetische genomen zouden het zoeken naar passende fagen voor patiëntmonsters kunnen versnellen en mogelijk het bewaren van tienduizenden fagen op ijs vervangen.
Moeilijke woorden
- genoom — Alle genetische informatie van een organisme.genomen
- synthetisch — Gemaakt door mensen, niet natuurlijk ontstaan.
- overwinnen — een probleem of moeilijkheid succesvol oplossen
- bemoeilijken — iets moeilijker of ingewikkelder makenbemoeilijkt
- concentratie — hoeveelheid van een stof per volume of massa
- functioneel — die werkt zoals bedoeld of bruikbaar isfunctionele
- versnellen — iets sneller laten gebeuren of verlopen
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Welke voordelen en mogelijke risico's zie je bij het gebruik van synthetische fagen voor patiënten?
- Hoe kan een bibliotheek van duizenden phagegenomen het werk van onderzoekers en artsen veranderen?
- Denk je dat synthetische genomen het bewaren van tienduizenden fagen op ijs kunnen vervangen? Waarom wel of niet?
Gerelateerde artikelen
Neustherapie laat hersentumoren bij muizen verdwijnen
Onderzoekers gebruiken neusdruppels met spherical nucleic acids om glioblastoom bij muizen te behandelen. De therapie activeert het STING-pad, maakte tumoren weg bij muizen en gaf langdurige immuniteit, vooral in combinatie met middelen voor T-lymfocyten.
Nieuw structuurbeeld van de T-celreceptor helpt therapieën verbeteren
Onderzoekers van The Rockefeller University onderzochten de T-celreceptor met cryo-EM in een membraanachtige omgeving. Ze vonden dat de receptor gesloten is in rust en openklapt bij een antigeen; dit inzicht kan T-celtherapieën verfijnen en uitbreiden.
Bloedtesten bij honden kunnen behandelresultaat van agressieve lymfoom voorspellen
Een onderzoek bij honden met agressieve bloedkanker vond genactiviteit in bloed die langetermijnoverleving voorspelt. Onderzoekers ontwikkelden een eenvoudige bloedtest die mogelijk behandeling kan sturen bij honden en mensen met lymfoom.