Onderzoekers rapporteerden een nieuwe aanpak om bacteriofaag‑genomen synthetisch te construeren en te bewerken. Graham Hatfull en collega’s werkten samen met andere wetenschappers en een bedrijf om processen te ontwikkelen die de technische hindernissen bij het maken van high‑GC‑DNA overwinnen. De bevindingen verschenen in Proceedings of the National Academy of Sciences.
De groep maakte chemisch identieke genomen van twee natuurlijke fagen die Mycobacterium aanvallen. Deze fagen hebben een hoge concentratie G‑ en C‑basen (ongeveer 65%), wat traditionele DNA‑synthese bemoeilijkt. De onderzoekers bouwden elk genoom in stukken en voegden die in een cel in; de cel las het genoom en produceerde functionele fagen. Een van de fagen, BPs, is een virus van 40,000 baseparen dat klinisch wordt gebruikt tegen een bacterie die vaak mensen met cystische fibrose infecteert; de andere, Bxb1, heeft 50,000 baseparen.
Het team merkt op dat er veel variatie is tussen fagen en dat de rol van veel genen nog onduidelijk is. Met nauwkeurige genoomwijzigingen kunnen onderzoekers specifieke genen verwijderen of veranderen en zo beter begrijpen hoe fagen werken. Het laboratorium van Hatfull bewaart 28,000 fagen en onderhoudt een bibliotheek van ongeveer 5,500 phagegenomen. Synthetische genomen zouden het zoeken naar passende fagen voor patiëntmonsters kunnen versnellen en mogelijk het bewaren van tienduizenden fagen op ijs vervangen.
Moeilijke woorden
- genoom — Alle genetische informatie van een organisme.genomen
- synthetisch — Gemaakt door mensen, niet natuurlijk ontstaan.
- overwinnen — een probleem of moeilijkheid succesvol oplossen
- bemoeilijken — iets moeilijker of ingewikkelder makenbemoeilijkt
- concentratie — hoeveelheid van een stof per volume of massa
- functioneel — die werkt zoals bedoeld of bruikbaar isfunctionele
- versnellen — iets sneller laten gebeuren of verlopen
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Welke voordelen en mogelijke risico's zie je bij het gebruik van synthetische fagen voor patiënten?
- Hoe kan een bibliotheek van duizenden phagegenomen het werk van onderzoekers en artsen veranderen?
- Denk je dat synthetische genomen het bewaren van tienduizenden fagen op ijs kunnen vervangen? Waarom wel of niet?
Gerelateerde artikelen
Hersenpad kan terugval bij opioïden verminderen
Onderzoekers van Washington State University vonden dat het verlagen van activiteit in een verbinding tussen de voorkant van de hersenen en de paraventriculaire thalamus drugsszoekgedrag vermindert in een preklinisch opioïdemodel. De studie staat in Journal of Neuroscience.
Ontstekingsremmers kunnen herstel na operatie vertragen
Een studie in de Journal of Pain Research toont dat het blokkeren van het immuunsignaal TNF-α direct na een operatie bij muizen herstel kan vertragen en pijn langer kan laten aanhouden. Onderzoekers waarschuwen voor te snelle toepassing bij mensen.
Tofersen vertraagt progressie bij SOD1‑ALS
Langdurige follow-up toont dat tofersen (Qalsody) de ziekteprogressie bij mensen met SOD1‑ALS kan vertragen en bij sommige patiënten stabilisatie of blijvende verbetering geeft. De studie liep meerdere jaren en rapporteert ook bijwerkingen en lopende onderzoeken.
Microben koloniseren pas gestolde lava bij Fagradalsfjall
Onderzoekers volgden hoe microben nieuwe lavastromen bij de Fagradalsfjall-vulkaan in IJsland snel koloniseren. Ze namen binnen enkele uren monsters en gebruikten DNA-analyse en machine learning om welke organismen kwamen en waar ze vandaan kwamen.
