Une équipe de chercheur·es a étudié le lien entre l'histoire évolutive des hôtes et la composition de leur microbiome intestinal dans le parc national d'Etosha, en Namibie. L'objectif était de tester la présence de phylosymbiose, c'est‑à‑dire l'idée que des espèces apparentées partagent des communautés microbiennes intestinales apparentées. Les auteur·rice·s ont prélevé des fèces fraîches auprès de 11 espèces d'herbivores et ont utilisé l'extraction d'ADN et le séquençage pour identifier les types et les abondances bactériennes propres à chaque espèce.
Les résultats montrent un contraste marqué : pour six espèces, il y a peu ou pas de preuve de phylosymbiose, alors que cinq espèces présentent des motifs compatibles. Ces cinq espèces — hartebeest roux, gnu bleu, oryx gazelle, impala et springbok — appartiennent toutes aux bovidés, des ruminants au système digestif complexe, et sont les plus étroitement apparentées de l'étude.
Les auteur·rice·s comparent ces résultats à des travaux antérieurs dans des écosystèmes africains plus tempérés, qui n'avaient pas mis en évidence de phylosymbiose chez les bovidés. Ils proposent que l'environnement local puisse masquer ou révéler ce signal : des zones plus humides et végétées augmenteraient la diversité microbienne et le bruit de fond, tandis que des milieux secs comme Etosha élimineraient des microbes mal adaptés à l'hôte ou à la végétation limitée, rendant les motifs liés aux hôtes plus visibles. L'équipe souligne que ce schéma pourrait être important alors que de nombreux écosystèmes s'assèchent sous l'effet du changement climatique. L'article est publié dans BMC Ecology and Evolution; des coauteur·rices sont affilié·es à l'Etosha Ecological Institute et à l'University of Georgia.
Mots difficiles
- phylosymbiose — similarité des communautés microbiennes selon parenté des hôtes
- microbiome — ensemble des micro-organismes vivant dans l'intestinmicrobiome intestinal
- ruminant — mammifère herbivore qui rumine sa nourritureruminants
- séquençage — méthode pour lire l'ADN d'un échantillon
- bruit de fond — variations non spécifiques qui masquent un signal
- abondance — quantité relative d'un type d'organismeabondances
Astuce : survolez, mettez le focus ou touchez les mots en surbrillance dans l’article pour voir des définitions rapides pendant que vous lisez ou écoutez.
Questions de discussion
- Que pourraient signifier ces résultats pour la conservation des espèces dans des régions qui s'assèchent ?
- Comment ces conclusions pourraient-elles influencer les études futures sur le microbiome dans différents habitats ?
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