Des chercheur·es ont cherché à savoir si les microbiomes intestinaux suivent la phylosymbiose, c'est‑à‑dire si des espèces hôtes apparentées ont des communautés microbiennes apparentées. L'étude s'est déroulée dans le parc national d'Etosha, en Namibie, un écosystème plutôt sec. Les équipes ont prélevé des échantillons de fèces fraîches auprès de 11 espèces d'herbivores, notamment éléphants, girafes, gnous, deux espèces de zèbres et plusieurs antilopes.
Après extraction d'ADN et séquençage, ils ont décrit les types et les abondances de bactéries dans chaque échantillon. Les résultats montrent un contraste : pour six espèces il y a peu ou pas de preuve de phylosymbiose, tandis que cinq espèces présentent des motifs compatibles avec ce schéma. Ces cinq espèces sont des bovidés ruminants avec des estomacs complexes, et elles sont étroitement apparentées.
Les auteur·rice·s suggèrent que l'environnement local peut masquer ou révéler la phylosymbiose. Dans des milieux plus humides, la diversité microbienne liée à la végétation peut créer du bruit, alors que des milieux secs comme Etosha peuvent éliminer des microbes mal adaptés et rendre les motifs liés aux hôtes plus visibles.
Mots difficiles
- phylosymbiose — lien entre parenté des hôtes et communautés microbiennes
- microbiome — ensemble des micro-organismes vivant dans l'intestinmicrobiomes intestinaux
- prélever — prendre un échantillon pour analyse scientifiqueprélevé
- séquençage — méthode pour déterminer l'ordre des bases d'ADN
- bovidé — mammifère de la famille des bovins et antilopesbovidés
- masquer — cacher ou rendre moins visible quelque chose
Astuce : survolez, mettez le focus ou touchez les mots en surbrillance dans l’article pour voir des définitions rapides pendant que vous lisez ou écoutez.
Questions de discussion
- Selon le texte, l'environnement peut masquer ou révéler la phylosymbiose. Pensez-vous que l'alimentation des herbivores a aussi une grande influence ? Pourquoi ?
- Si vous étudiiez des animaux dans un milieu humide, quelles difficultés le texte prévoit-il pour observer la phylosymbiose ?
- Les chercheurs ont utilisé des échantillons de fèces. Quels avantages et inconvénients voyez-vous pour cette méthode ?
Articles liés
Grande diversité microbienne trouvée dans le microbiome africain
Une étude menée par des chercheurs sud-africains a analysé le microbiome intestinal d’environ 1 800 femmes dans plusieurs pays africains. Les équipes ont trouvé des milliers d’espèces microbiennes inconnues et des différences liées au VIH et au mode de vie.