Veel nieuwe darmmicroben ontdekt in Afrika ^{CEFR B2}

Onderzoekers van het Sydney Brenner Institute for Molecular Bioscience (SBIMB) van de University of the Witwatersrand publiceerden in Nature een omvangrijke studie over het darmmicrobioom van Afrikaanse bevolkingsgroepen. Zij verzamelden ontlastingsmonsters van ongeveer 1,800 vrouwen in Kenia, Ghana, Burkina Faso en Zuid-Afrika en gebruikten genetische sequencing om de micro-organismen te identificeren.

De studie bracht meer dan 1,000 nieuwe bacteriesoorten en meer dan 40,000 nieuwe virussen aan het licht; in totaal spreken de auteurs van meer dan 40,000 eerder onbekende darmmicroben bij Afrikaans bevolkingsonderzoek. Belangrijk was de vondst van een unieke microbiële handtekening die samenhangt met hiv. Dit onderzoek is de grootste tot nu toe naar microbiomen van vrouwen met hiv en laat zien dat de bacteriële patronen bij mensen met hiv in Afrika fundamenteel anders zijn dan in rijkere landen. Die verschillen kunnen leiden tot nieuwe manieren om hiv bij Afrikaanse populaties op te sporen, te volgen en te behandelen.

Het team vond ook duidelijke verschillen tussen platteland en stad: plattelandsdeelnemers hadden over het algemeen rijkere, meer diverse darmbacteriën, terwijl stedelijke deelnemers vaak de bacterie Treponema misten, mogelijk door vezelarmere diëten en vaker antibioticagebruik. Charissa Naidoo van het African Microbiome Institute waarschuwde dat gunstige darmbacteriën verdwijnen naarmate stedelijke levensstijlen en antibioticagebruik toenemen, en riep op tot urgente voedingsinterventies om microbiomendiversiteit te behouden. De onderzoekers benadrukken bovendien dat diversiteit varieert tussen steden en regio's en dat lokale voeding, omgeving en culturele gebruiken het microbioom vormen. Zij willen het werk uitbreiden om verbanden te onderzoeken met slaapproblemen, de menopauze, hersenziekten en tuberculose. Het stuk is gemaakt door de Engelstalige Sub-Saharan Africa-redactie van SciDev.Net.