Araştırma ekibi, Mycobacterium’u hedef alan iki doğal fajın dizilimleri temelinde sentetik DNA modelleri oluşturdu. Mycobacterium grubu tüberküloz ve cüzzamdan sorumlu patojenleri içeriyor. Elde edilen sentetik genomlar başarılı şekilde düzenlendi ve bulgular Proceedings of the National Academy of Sciences dergisinde yayınlandı.
Bazı faj genomları kimyasal yapıları nedeniyle inşa etmekte zordur; bu fajlarda G ve C oranı yaklaşık 65% düzeyindedir. Geleneksel DNA sentezi yüksek GC içeren dizilerde teknik sorunlar veriyor, oysa E. Coli gibi daha dengeli baz oranlarına sahip genomlar daha kolay düzenlenebiliyor.
University of Pittsburgh’dan Graham Hatfull, New England Biolabs’den Greg Lohman ve Ansa Biotech işbirliğiyle çalıştı. Ekip BPs (40,000 baz çifti) ve Bxb1 (50,000 baz çifti) olmak üzere iki genomu 12 bölüm halinde inşa etti ve bu bölümleri bir hücreye yerleştirerek faj üretimini sağladı. Sentetik genomlar hasta örnekleriyle eşleştirme sürecini hızlandırabilir.
Zor kelimeler
- faj — Bakterilere enfekte olan küçük virüs.fajın, fajlarda
- genom — Bir canlının tüm genetik bilgi seti.genomlar, genomları, genomu
- dizilim — DNA veya RNA üzerindeki nükleotid sırası.dizilimleri
- patojen — Hastalık yapan mikroorganizma veya virüs.patojenleri
- baz oranı — DNA'da farklı bazların yüzde oranı.baz oranlarına
- düzenlemek — Genetik materyalde değişiklik yapmak amacıyla.düzenlendi, düzenlenebiliyor
- inşa etmek — Bir şeyi kurmak veya oluşturmak.inşa etmekte, inşa etti
- baz çifti — DNA'da eşleşmiş iki nükleotid birimi.
İpucu: Türkçe metni okurken veya ses kaydını dinlerken, vurgulanan kelimelerin üzerine gel, odaklan ya da dokun; anında kısa tanımlar görünür.
Tartışma soruları
- Sentetik genomların hasta örnekleriyle eşleştirme sürecini hızlandırması neden önemli olabilir? Kısa açıklayınız.
- Yüksek G ve C oranı sentezi zorlaştırıyor. Laboratuvarda böyle bir sorunla karşılaşırsanız hangi çözümleri düşünürdünüz?
- Bu tür sentetik genom çalışmaları size göre hangi faydaları veya riskleri getirebilir? Kısa yazınız.
İlgili makaleler
Yale: Epiregulin ve EGFR-STAT1 yolları fibrozda umut veriyor
Yale Tıp Fakültesi araştırmacıları, epireguline yönelik insan monoklonal antikor ve EGFR-STAT1 yolunu ilişkilendiren bulgular bildirdi. Çalışmalar epiregulinin bloklanmasının fibroz belirteçlerini azalttığını ve yeni tedavi yolları önerdiğini gösteriyor.
Novartis'in yeni sıtma ilacı GanLum güçlü sonuçlar gösterdi
Novartis tarafından geliştirilen GanLum, içinde ganaplacide molekülü olan yeni bir sıtma tedavisidir. Geç aşama denemede güçlü sonuçlar verdi ve ilaç direncine karşı umut olabilir; onaylar yaklaşık 16 months içinde bekleniyor.