Araştırma ekibi, Mycobacterium’u hedef alan iki doğal fajın dizilimleri temelinde sentetik DNA modelleri oluşturdu. Mycobacterium grubu tüberküloz ve cüzzamdan sorumlu patojenleri içeriyor. Elde edilen sentetik genomlar başarılı şekilde düzenlendi ve bulgular Proceedings of the National Academy of Sciences dergisinde yayınlandı.
Bazı faj genomları kimyasal yapıları nedeniyle inşa etmekte zordur; bu fajlarda G ve C oranı yaklaşık 65% düzeyindedir. Geleneksel DNA sentezi yüksek GC içeren dizilerde teknik sorunlar veriyor, oysa E. Coli gibi daha dengeli baz oranlarına sahip genomlar daha kolay düzenlenebiliyor.
University of Pittsburgh’dan Graham Hatfull, New England Biolabs’den Greg Lohman ve Ansa Biotech işbirliğiyle çalıştı. Ekip BPs (40,000 baz çifti) ve Bxb1 (50,000 baz çifti) olmak üzere iki genomu 12 bölüm halinde inşa etti ve bu bölümleri bir hücreye yerleştirerek faj üretimini sağladı. Sentetik genomlar hasta örnekleriyle eşleştirme sürecini hızlandırabilir.
Zor kelimeler
- faj — Bakterilere enfekte olan küçük virüs.fajın, fajlarda
- genom — Bir canlının tüm genetik bilgi seti.genomlar, genomları, genomu
- dizilim — DNA veya RNA üzerindeki nükleotid sırası.dizilimleri
- patojen — Hastalık yapan mikroorganizma veya virüs.patojenleri
- baz oranı — DNA'da farklı bazların yüzde oranı.baz oranlarına
- düzenlemek — Genetik materyalde değişiklik yapmak amacıyla.düzenlendi, düzenlenebiliyor
- inşa etmek — Bir şeyi kurmak veya oluşturmak.inşa etmekte, inşa etti
- baz çifti — DNA'da eşleşmiş iki nükleotid birimi.
İpucu: Türkçe metni okurken veya ses kaydını dinlerken, vurgulanan kelimelerin üzerine gel, odaklan ya da dokun; anında kısa tanımlar görünür.
Tartışma soruları
- Sentetik genomların hasta örnekleriyle eşleştirme sürecini hızlandırması neden önemli olabilir? Kısa açıklayınız.
- Yüksek G ve C oranı sentezi zorlaştırıyor. Laboratuvarda böyle bir sorunla karşılaşırsanız hangi çözümleri düşünürdünüz?
- Bu tür sentetik genom çalışmaları size göre hangi faydaları veya riskleri getirebilir? Kısa yazınız.
İlgili makaleler
Beyindeki bir devre opioid nüksünü azaltabilir
Araştırmacılar prelimbik korteks ile paraventriküler talamus arasındaki bağlantıyı hedeflemenin opioid tekrar bağımlılığını önlemeye yardımcı olabileceğini bildirdi. Çalışma Washington State Üniversitesi'nden ve Journal of Neuroscience dergisinde yayımlandı.
Alternatif RNA işlenmesi ve memeli ömrü
Yeni çalışma, alternatif RNA işlenmesinin 26 memeli türü arasında 2.2 ila 37 yıl arasındaki ömür farklarını açıklamaya yardımcı olabileceğini gösteriyor. Analiz altı doku, özellikle beyni inceliyor ve bulgular RNA bağlayan proteinlerle kontrol edilen kesilme desenlerine işaret ediyor.