Araştırma ekibi, Mycobacterium’u hedef alan iki doğal fajın dizilimleri temelinde sentetik DNA modelleri oluşturdu. Mycobacterium grubu tüberküloz ve cüzzamdan sorumlu patojenleri içeriyor. Elde edilen sentetik genomlar başarılı şekilde düzenlendi ve bulgular Proceedings of the National Academy of Sciences dergisinde yayınlandı.
Bazı faj genomları kimyasal yapıları nedeniyle inşa etmekte zordur; bu fajlarda G ve C oranı yaklaşık 65% düzeyindedir. Geleneksel DNA sentezi yüksek GC içeren dizilerde teknik sorunlar veriyor, oysa E. Coli gibi daha dengeli baz oranlarına sahip genomlar daha kolay düzenlenebiliyor.
University of Pittsburgh’dan Graham Hatfull, New England Biolabs’den Greg Lohman ve Ansa Biotech işbirliğiyle çalıştı. Ekip BPs (40,000 baz çifti) ve Bxb1 (50,000 baz çifti) olmak üzere iki genomu 12 bölüm halinde inşa etti ve bu bölümleri bir hücreye yerleştirerek faj üretimini sağladı. Sentetik genomlar hasta örnekleriyle eşleştirme sürecini hızlandırabilir.
Zor kelimeler
- faj — Bakterilere enfekte olan küçük virüs.fajın, fajlarda
- genom — Bir canlının tüm genetik bilgi seti.genomlar, genomları, genomu
- dizilim — DNA veya RNA üzerindeki nükleotid sırası.dizilimleri
- patojen — Hastalık yapan mikroorganizma veya virüs.patojenleri
- baz oranı — DNA'da farklı bazların yüzde oranı.baz oranlarına
- düzenlemek — Genetik materyalde değişiklik yapmak amacıyla.düzenlendi, düzenlenebiliyor
- inşa etmek — Bir şeyi kurmak veya oluşturmak.inşa etmekte, inşa etti
- baz çifti — DNA'da eşleşmiş iki nükleotid birimi.
İpucu: Türkçe metni okurken veya ses kaydını dinlerken, vurgulanan kelimelerin üzerine gel, odaklan ya da dokun; anında kısa tanımlar görünür.
Tartışma soruları
- Sentetik genomların hasta örnekleriyle eşleştirme sürecini hızlandırması neden önemli olabilir? Kısa açıklayınız.
- Yüksek G ve C oranı sentezi zorlaştırıyor. Laboratuvarda böyle bir sorunla karşılaşırsanız hangi çözümleri düşünürdünüz?
- Bu tür sentetik genom çalışmaları size göre hangi faydaları veya riskleri getirebilir? Kısa yazınız.
İlgili makaleler
Buğday lifi farelerde bağırsak iltihabını azalttı
Araştırmalar, buğday lifi verilen farelerin bağırsak iltihabına karşı korunduğunu gösterdi. Bulgular, bağırsak bakterilerinin lifleri metabolize edip polifenoller gibi iltihap karşıtı maddeler ürettiğini ve bunun koruyucu olduğunu belirtiyor.
Kerala, Bacillus subtilis'i "eyalet mikrobu" ilan etti
Kerala, Hindistan'da Bacillus subtilis'i eyalet mikrobu ilan etti. Karar, faydalı mikroorganizmaların sağlık, gıda güvenliği, çevre ve iklim dayanıklılığına katkılarını vurgulamayı amaçlıyor ve yeni Mikrobiyom Mükemmeliyet Merkezi ile bağlantılı.
Ağaç farelerinin çıngıraklı yılan zehrine karşı genetik direnci
Araştırma, ağaç farelerinin çıngıraklı yılan zehrine karşı genetik değişikliklerle direnç geliştirmiş olabileceğini gösteriyor. Çalışma SERPINA3 genindeki kopya artışını ve bu genin ürettiği proteinlerin zehri nasıl etkisizleştirdiğini inceliyor; deneyler Michigan Üniversitesi laboratuvarında yapıldı.
