Araştırmacılar inflamatuar meme kanseri (IBC) ile diğer meme kanseri alt tipleri arasında ayrım yapabilen birkaç potansiyel kan temelli biyobelirteç belirledi. Çalışma, Thermostable Group II Intron Reverse Transcriptase (TGIRT) adı verilen ve karmaşık ile parçalanmış RNA’ları yakalamada üstünlük gösteren bir RNA dizileme yaklaşımını kullandı; TGIRT, Alan Lambowitz’in The University of Texas at Austin’deki ekibi tarafından geliştirildi. Klinik örnekler ve tıbbi veriler The University of Texas MD Anderson Cancer Center’dan sağlandı; örnek sağlayan ekipte Savitri Krishnamurthy ve o dönemde MD Anderson Morgan Welch İnflamatuar Meme Kanseri Programı’nda görevli Naoto Ueno yer aldı.
TGIRT dizileme her örnekteki RNA türlerinin ve miktarlarının daha eksiksiz bir görünümünü verdi. Araştırmacılar IBC tümörlerine özgü protein kodlayan genleri analiz etme yöntemleri geliştirdi ve IBC hastalarının kanında, sağlıklı veya IBC dışı hastalara göre daha yüksek düzeyde kodlamayan RNA ile daha yüksek beyaz kan hücresi sayıları saptandı. Bu desenler bağışıklık aktivasyonuna ve mRNA üretimini azaltan RNA splicing dengesizliklerine işaret ediyor.
Plazmada IBC örnekleri çok sayıda intron RNA parçacığı içerirken, sağlıklı plazmada çoğunlukla mRNA parçacıkları taşındı. Bu farklılıklar tümörler, periferik kan hücreleri ve plazma arasında da gözlendi. Araştırmacılar bu biyobelirteçlerin IBC tanı ve izlemini geliştirebileceğini ve bu hasta grubuna yönelik yeni tedavilerin geliştirilmesine katkı sağlayabileceğini belirtiyor. Çalışma National Institutes of Health, The Welch Foundation, Breast Cancer Research Foundation, UT MD Anderson Morgan Welch Inflammatory Breast Cancer Research Program and Clinic ve State of Texas Rare and Aggressive Breast Cancer Research Program tarafından finanse edildi; yazar listesi ve açıklamalar Science Advances dergisindeki makalede yer alıyor. Kaynak: UT Austin.
Zor kelimeler
- inflamatuar meme kanseri — Meme dokusunda hızlı ve agresif tür kanser.inflamatuar meme kanseri (IBC), IBC
- biyobelirteç — Hastalığı gösteren veya izlemeye yarayan kan işareti.biyobelirteçlerin
- dizileme — Genetik materyalin sırasını belirleme yöntemi.
- kodlamayan RNA — Protein üretmeyen fakat hücrede görevli RNA.
- intron — Gen içindeki, çıkarılan RNA bölümü.
- plazma — Kanın hücreler dışında kalan sıvı kısmı.Plazmada
İpucu: Türkçe metni okurken veya ses kaydını dinlerken, vurgulanan kelimelerin üzerine gel, odaklan ya da dokun; anında kısa tanımlar görünür.
Tartışma soruları
- Kan tabanlı biyobelirteçlerin inflamatuar meme kanseri tanı ve takibine sağlayabileceği somut faydalar neler olabilir?
- TGIRT dizileme gibi daha eksiksiz RNA profili veren yöntemlerin hastane laboratuvarlarında uygulanması önünde hangi zorluklar olabilir?
- Bu çalışmada bulunan biyobelirteçler yeni tedavi geliştirme sürecini nasıl etkileyebilir? Örneklerle açıklayınız.
İlgili makaleler
Nijerya'da WHO lisanslı hızlı test kiti fabrikası üretime başladı
Nijerya'da Codix adlı WHO lisanslı tesis bu ay 147 milyon hızlı tanı kiti üretimine başladı. Üretimin büyük bölümü yerelden sağlanıyor, şirket yerel içerik oranını artırmayı ve enzimleri yurtiçinde üretmeyi hedefliyor.
