Araştırmacılar inflamatuar meme kanserini (IBC) diğer meme kanseri alt tiplerinden ayırt edebilen kan temelli biyobelirteçler belirledi. IBC ve IBC dışı tümörlerin genelde benzer kanser mutasyonlarını paylaşması nedeniyle net biyobelirteç bulmak zordu. Standart RNA dizileme yöntemlerinin kullandığı enzimler karmaşık veya bozulmuş RNA ile iyi başa çıkamıyor, bu yüzden bazı önemli RNA molekülleri gözden kaçıyordu.
Çalışmada daha sağlam bir enzim kullanan TGIRT benzeri bir yöntemle, karmaşık ve parçalanmış RNA’lar daha iyi yakalandı ve örnek başına RNA tipleri ile miktarları daha eksiksiz görüldü. Araştırmacılar IBC tümörlerine özgü protein kodlayan genleri analiz etme yöntemleri geliştirdi.
Analizler, IBC hastalarının kanında kodlamayan RNA düzeylerinin ve beyaz kan hücresi sayılarının daha yüksek olduğunu gösterdi. Plazmada IBC örnekleri çok sayıda intron RNA parçacığı içerirken, sağlıklı plazmada çoğunlukla mRNA parçacıkları tespit edildi. Bu desenler bağışıklık aktivasyonu ve RNA splicing dengesizliklerine işaret ediyor. Bulgular tanı, izlem ve yeni tedavilerin geliştirilmesini destekleyebilir.
Zor kelimeler
- inflamatuar — vücutta iltihap veya iltihabi tepkiyle ilgili
- biyobelirteç — hastalığı veya durumu gösteren ölçülebilir maddebiyobelirteçler
- dizileme — RNA veya DNA dizisinin sıralanma işlemi
- enzim — canlılarda kimyasal tepkileri hızlandıran proteinenzimler
- plazma — kanda hücreler dışında kalan sıvı bölümPlazmada
- intron — genlerde bazı RNA parçalarının atıldığı bölüm
- splicing — RNA parçalarının uygun şekilde birleştirilmesi süreci
- kodlamayan RNA — protein üretmeyen, farklı işlevleri olan RNA türleri
İpucu: Türkçe metni okurken veya ses kaydını dinlerken, vurgulanan kelimelerin üzerine gel, odaklan ya da dokun; anında kısa tanımlar görünür.
Tartışma soruları
- Bu yeni kan temelli biyobelirteçler tanıda nasıl yardımcı olabilir? Kısa cevap veriniz.
- Plazmada çok sayıda intron RNA parçacığı bulunmasının bağışıklık aktivasyonu veya splicing dengesizlikleriyle nasıl ilişkili olabileceğini düşünüyorsunuz?
- Yeni yöntemler daha eksiksiz RNA profilleri gösterdiğine göre, bu tür teknik gelişmelerin hasta takibi ve tedavi geliştirmede sağlayacağı yararlar neler olabilir?
İlgili makaleler
Yapay zekâ destekli kan testi demansları ayırt ediyor
Araştırmacılar yapay zekâ tabanlı bir kan testi geliştirdi. Test, Alzheimer, Parkinson ve diğer yaygın demans nedenlerini ile normal yaşlanmayı yüksek doğrulukla ayırabiliyor; ancak klinik kullanım için ek doğrulamaya ihtiyaç var.
