Ricercatori hanno messo a punto un metodo per costruire genomi sintetici completi di batteriofagi e per modificare con precisione singoli geni. La tecnica risponde alla crescente esigenza di alternative agli antibiotici e può aiutare a progettare fagi con applicazioni cliniche più ampie.
Il gruppo ha modellato il DNA sintetico su due fagi naturali che attaccano Mycobacterium: BPs, un virus di 40,000 coppie di basi usato clinicamente per trattare un batterio che spesso infetta persone con fibrosi cistica, e Bxb1, con 50,000 coppie di basi. I ricercatori hanno costruito ogni genoma in 12 sezioni e poi le hanno inserite in una cellula. La cellula ha seguito le istruzioni del nuovo genoma e ha prodotto fagi. I risultati sono pubblicati sul Proceedings of the National Academy of Sciences.
Alcuni genomi sono difficili da sintetizzare per la loro composizione: il DNA usa quattro basi, A, T, C e G, e i fagi che attaccano Mycobacterium hanno circa il 65% di G e C. Per superare questi ostacoli Graham Hatfull dell'University of Pittsburgh ha collaborato con Greg Lohman di New England Biolabs e con Ansa Biotech; il primo autore è Ching-Chung Ko. Il laboratorio di Hatfull conserva 28,000 fagi e una libreria di circa 5,500 genomi. I genomi sintetici potrebbero velocizzare la ricerca e ridurre la necessità di conservare decine di migliaia di campioni fisici.
Parole difficili
- genoma — sequenza completa del DNA di un organismogenomi
- batteriofago — virus che infetta e uccide batteribatteriofagi
- sintetizzare — produrre artificialmente una sostanza o struttura
- coppia di basi — due basi collegate nella struttura del DNAcoppie di basi
- precisione — esecuzione con accuratezza e senza errori
- libreria — collezione organizzata di materiali o dati
- esigenza — bisogno o richiesta importante e urgente
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Domande di discussione
- Quali vantaggi potrebbero avere i fagi progettati clinicamente rispetto agli antibiotici? Spiega con esempi.
- Come potrebbe cambiare il lavoro dei laboratori la riduzione della necessità di conservare decine di migliaia di campioni fisici?
- Quali problemi tecnici menziona l'articolo nella sintesi dei genomi e come pensi si possano affrontare?
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