Circadiaanse ritmes helpen het lichaam de lokale tijd bij te houden en de suprachiasmatische kern (SCN) fungeert als centrale pacemaker. Een interdisciplinair team van Washington University in St. Louis bouwde een nieuw computationeel hulpmiddel, MITE (Mutual Information and Transfer Entropy, uitgesproken “mighty”), om te achterhalen hoe SCN-cellen met elkaar communiceren. Het werk, onder leiding van Erik Herzog en KL Nikhil en met medewerking van onder anderen Daniel Granados-Fuentes, Jr-Shin Li, Bharat Singhal en István Kiss, werd gepubliceerd in de Proceedings of the National Academy of Sciences.
Door wekenlange opnamen van genexpressie met cellulaire resolutie reconstrueerde het team meer dan 25 miljoen verbindingen tussen meer dan 8.000 cellen in 17 muizen, met een nauwkeurigheid van meer dan 95%. Hoewel de muis-SCN ongeveer 20.000 neuronen bevat, bleek slechts een kleine subset van sterk verbonden hub-cellen essentieel voor synchronisatie. De onderzoekers onderscheiden vijf functionele celtypes op basis van verbindingsbreedte en communicatiepartners, waaronder zwaar verbonden hub-cellen (met een kleine subset VIP-expressieve neuronen die synchronisatiesignalen uitzenden), bridge-cellen die signalen doorgeven, en sink-cellen die convergerende signalen ontvangen.
Computationale modellen toonden dat het verwijderen van alleen hub-neuronen de synchronisatie in het netwerk liet instorten, wat hun cruciale rol bevestigt. Vervolgonderzoek moet verduidelijken hoe hub-cellen hun invloed uitoefenen en of gerichte interventies de SCN-timing kunnen bijsturen. De nieuwe tool kan zo helpen bij strategieën om de lichaamsklok opnieuw uit te lijnen en mogelijk voordeel te bieden voor ploegendienstwerkers, mensen met seizoensgebonden affectieve stoornis en anderen met circadiaanse problemen.
Moeilijke woorden
- circadiaans ritme — biologische activiteit die het dag- en nachtpatroon volgtCircadiaanse ritmes
- suprachiasmatische kern — klein hersengebied dat de lichaamsklok regelt
- computationeel hulpmiddel — computerprogramma dat gegevens analyseert en helpt
- genexpressie — productie van eiwitten door genen in cellen
- cellulaire resolutie — beeld of meting met individuele cellen zichtbaar
- hub-cel — weinig maar sterk verbonden cel in netwerkhub-cellen
- synchronisatie — gelijktijdig optreden of gelijklopen van activiteiten
- instorten — plotseling ophouden met functioneren of werken
- verbindingsbreedte — hoeveelheid of sterkte van verbindingen tussen cellen
- interventie — gerichte actie om een proces te verandereninterventies
Tip: beweeg de muisaanwijzer over gemarkeerde woorden in het artikel, of tik erop om snelle definities te zien terwijl je leest of luistert.
Discussievragen
- Welke voordelen en beperkingen ziet u bij het gebruiken van een computationeel hulpmiddel om de lichaamsklok opnieuw uit te lijnen?
- Hoe zou gerichte interventie op hub-cellen invloed kunnen hebben op iemands dagelijks leven of werkrooster?
- Welke stappen zijn volgens u nodig om resultaten uit muizenonderzoek naar veilige toepassingen voor mensen te vertalen?
Gerelateerde artikelen
Gen verlaagt achtergrondruis en verbetert aandacht bij muizen
Onderzoekers ontdekten dat variatie in het Homer1-gen de achtergrondactiviteit in de prefrontale cortex verlaagt en de aandacht verbetert bij muizen. Het werk, geleid door Priya Rajasethupathy, verschijnt in Nature Neuroscience.
Klimaatverschuivingen vormden lichaamsvormen van carnivoren
Nieuw onderzoek laat zien dat twee grote klimaatveranderingen in het verleden de lichaamsvormen van carnivoren hebben beïnvloed. Wetenschappers bestudeerden skeletvormen van bijna 200 soorten om te zien wanneer en hoe die veranderingen plaatsvonden.
Vogelgriep bij zwarte gieren in de Verenigde Staten
Onderzoekers van de University of Georgia vonden H5N1-vogelgriep bij zwarte gieren in zeven staten. Ze waarschuwen dat jaarlange circulatie het risico op mutaties vergroot en grote gevolgen kan hebben voor zeldzame vogels en landbouwdieren.
Nieuwe methode maakt tagatose uit glucose
Onderzoekers ontwikkelden een manier om tagatose, een zeldzame suiker met suikerachtige smaak en minder calorieën, biosynthetisch te maken uit glucose. De aanpak gebruikt aangepaste bacteriën en een nieuw enzym en levert hogere opbrengsten dan eerdere methoden.
Dzoodzo Baniwa wint prijs voor inheemse oplossingen tegen klimaatcrisis
Dzoodzo Baniwa uit het Alto Río Negro-territorium won een prijs van de Bunge Foundation voor zijn werk rond de klimaatcrisis en innovatieve landbouwoplossingen. Hij verbindt voorouderlijke kennis met wetenschappelijke praktijk en ontwikkelde een waterpompsysteem zonder elektriciteit.