Svisaj esploristoj identigis sang-bazitajn biomarkilojn kiuj klare distingas inflaman mamkanceron (IBC) de aliaj mamsarkaj subtipaj. La laboro, publikigita en Science Advances, indikas ke malpli invasa likva biopsio per sango povus helpi en frua detekto, en sekvado de la malsana progresado kaj en gvidado de evoluo de terapioj por ĉi tiu agresema formo de kancero.
La teamo uzis TGIRT-sekvencigon, novan RNA-sekvencigan metodon kiu estis evoluigita de la teamo de Alan Lambowitz ĉe The University of Texas at Austin. Klinikaj specimenoj kaj medicinaj datumoj venis de Savitri Krishnamurthy, profesoro de anatomia patologio ĉe The University of Texas MD Anderson Cancer Center, kaj de Naoto Ueno, tiam profesoro ĉe la Morgan Welch Inflammatory Breast Cancer Program and Clinic ĉe UT MD Anderson kaj nun direktoro de la University of Hawai’i Cancer Center. Krishnamurthy remarkis, ke sang-bazitaj biomarkiloj povus ebligi al klinikistoj facile monitori progreson per likva biopsio.
Trovi klarajn biomarkilojn estis malmola, ĉar IBC kaj ne-IBC ofte dividas similajn genmutaciojn kaj ĉar normalaj RNA-sekvencaj metodoj malmulte kaptis kompleksajn aŭ degraditajn RNA-ojn. TGIRT uzas pli tolereman enzymon, kiu kaptas kompleksajn kaj fragmentitajn RNA-ojn kaj tiel disponigas pli kompletan bildon de la RNA-specoj kaj kvantoj en ĉiu specimeno. La esploristoj ankaŭ evoluigis analizmetodojn por protein-kodantaj genoj specife asociitaj kun IBC-tumoroj.
Rezulte, sango de IBC-pacientoj montris pli altajn nivelojn de ne-kodaj RNA-oj kaj pli altajn blankajn sangelementajn nombrojn ol sango de sanaj aŭ ne-IBC pacientoj. En plasmao IBC-specimenoj enhavis multajn intronajn RNA-fragmentojn, dum sana plasmao portis ĉefe mRNA-fragmentojn; ĉi tiuj diferencoj aperis en tumoroj, periferiaj sangoceloj kaj plasmao. La laboro estis financita de National Institutes of Health, The Welch Foundation, la Breast Cancer Research Foundation, la UT MD Anderson Morgan Welch Inflammatory Breast Cancer Research Program and Clinic, kaj la State of Texas Rare and Aggressive Breast Cancer Research Program. Plena listo de aŭtoroj kaj malkovroj disponeblas kun la artikolo en Science Advances (Source: UT Austin).
Malfacilaj vortoj
- biomarkilo — substanco aŭ signo utila por diagnozo kaj detektobiomarkilojn, biomarkiloj
- likva biopsio — testo per sango, malpli invasa ol kirurgio
- TGIRT-sekvencigo — RNA-sekvenciga metodo kiu kaptas fragmentitajn RNA-ojnTGIRT-sekvencigon
- fragmentita — rompita aŭ malkompleta peco de RNA aŭ alia materialofragmentitajn
- protein-kodanta geno — geno kiu portas informon por fari proteinonprotein-kodantaj genoj
- plasmao — la likva parto de sango sen sangokorpoj
- analizmetodo — maniero por prilabori kaj interpreti sciencajn datumojnanalizmetodojn
Konsilo: ŝovu la musmontrilon, fokusu aŭ tuŝu la reliefigitajn vortojn en la artikolo por vidi rapidajn difinojn dum legado aŭ aŭskultado.
Diskutaj demandoj
- Kiajn avantaĝojn havus malpli invasa likva biopsio por frua detekto kaj sekvado de malsano?
- Kiel la kapablo kapti kompleksajn kaj fragmentitajn RNA-ojn povas influi komprenon de tumoraj specoj?
- Kiaj praktikeblaj paŝoj necesus por enkonduki sang-bazitajn biomarkilojn en norman klinikan uzadon?
Rilataj artikoloj
Sangaj piRNAj povas antaŭdiri mallongtempan supervivon ĉe maljunaj plenkreskuloj
Sciencistoj trovis, ke malgrandaj RNA-molekuloj nomataj piRNAj en sango povis antaŭdiri dujaran supervivon por plenkreskuloj 71+; rezultoj el Duke Health kaj kunlaborantoj aperas en la ĵurnalo Aging Cell.
